Gennem årene har Pokemon franchisen indført en række legendariske Pokemon der kan opfanges af spilleren, med en god del af dem til rådighed i den helt nye pokemon Omega Ruby og Alpha Sapphire. Mens den oprindelige Ruby, Sapphire og Emerald havde Groudon, Kyogre, og Rayquaza i spidsen, var der også de nye legendaries af Latios og Latias, hvoraf den ene kan fanges i hver af de tre, hvor sidstnævnte var valget af afspilleren.
Som en genindspilning af Generation III, vil spillerne få mulighed for at få en af de to igen, også afhængigt af den version plukket. De, der er at spille Pokemon Omega Ruby får Latios mens de spiller Pokemon Alpha Sapphire får Latias. Heldigvis, i stedet for at skulle finde dem gennem frustrerende tilfældige møde scenarie set med de tre hunde af Johto, spilleren bogstaveligt gives en her.
Efter at have besejret hovedpersonens far i Petalburg City og få den femte gym badge , Wally vil bede spilleren til at gå med ham til Mauville City. Gør så spilleren ikke har Fly helt endnu. Følg stien til højre efter dette, og du vil til sidst løbe ind Steven. Afhængigt af den version, du har, vil Steven have den anden af de to Latios eller Latias, der vil tage dig begge skyward.
På dette tidspunkt, spilleren vil komme på tværs Latias /Latios og nødt til at beskytte det fra enten Team Aqua eller Team Magma, afhængigt af den version du har. Specielt i Alpha Sapphire, vil du stå:
Aqua Admin Matt og Team Aqua Grunt
-admin: Sharpedo - Level 31 (Vand /Mørk)
-Grunt: Grimer - Level 29 (Poison)
Efter at have besejret disse to, vil Latias /Latios se dig som en passende træner og bede om at deltage i dit team. I modsætning til de fleste øjeblikke i serien, hvor du bliver nødt til at gå til en Pokemon Center og åbne op for en plet på din vagtplan for det, vil spillet automatisk kan du vælge en i din fest til at sende tilbage til pc'en. Nu har du din egen Level 30 Latias eller Latios.
Derudover vil spilleren også få de respektive Mega Evolution sten, i Latias 'tilfælde er det Latiasite. Efter dette, vil Steven derefter give dig Mega Bracelet så godt, så du kan få adgang til Mega Evolution for første gang i spillet med din respektive nyerhvervede legendariske Pokemon.